博士生导师
周丰丰
基本情况
姓名: 周丰丰

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性别:
职称: 教授
最高学历: 研究生
最高学位: 博士
Email:

ffzhou@jlu.edu.cn

“唐敖庆”教授,中科院“百人计划”

备注: 我的实验室是Health Informatics Lab,简称HILab,欢迎大家访问HILab网站:http://www.healthinformaticslab.org/.
详细情况
所在学科专业:

计算机科学与技术方向,计算机应用(学术博士、学术硕士)

软件工程方向,电子信息(软件工程,专业硕士)


近期新闻(HILab论文发表情况见下表)

  • 恭喜HILab多位本科生取得清华大学和北京大学等高等学府2020年继续深造!也预祝其他HILabers拿到心仪高校和公司的offers!

  • 恭喜HILab多位本科生取得CMU, NYU, ETHZ, 清华大学,北京大学等高等学府2019年继续深造!

  • 恭喜HILab多位本科生取得CMU, Columbia Univ, Pits Univ,清华大学等高等学府2018年继续深造!

所研究方向:

生物信息学,健康大数据挖掘,深度学习,并行计算等

讲授课程: 健康大数据挖掘,机器学习与Python,Python编程等
教育经历:

1996-2000:  中国科学技术大学,少年班学院,计算机软件

2000-2005:  中国科学技术大学,计算机学院,计算机软件

工作经历:

  教授,博士生导师,中国科学院百人计划,吉林大学“唐敖庆”特聘教授,IEEE(美国电气和电子工程师协会)高级会员。团队主要从事健康大数据挖掘核心算法、以及融合生物组学、医学影像、心电脑电和电子病历等异构医学大数据的融合建模算法等方面的研究。

  主持或参与包括863和中科院先导等各级别项目,主持金额合计近500万元。已发表学术论文70篇,其中包括SCI索引67篇。根据SCI数据库统计,总引用次数1279次,他引次数999次。学术成果多次在包括Nature Protocols、Nucleic Acids Research、和Bioinformatics等学术期刊上发表。相关成果连续荣获多次国际疾病预测竞赛较好排名。应邀担任多个SCI索引期刊的副主编或编委,并多次(每一类均超过20次)应邀评审国际和国内项目标书、国际学术期刊和会议的投稿论文。

  目前已毕业的学生找到的工作机会包括百度和南方信投等大数据挖掘领域的大数据分析师等职位,也有多位HILabers选择 国内外顶级高校继续深造。欢迎有志于从事大数据领域研究和开发的同学申请和报考本实验室的计算机应用专业学术博士和学术硕士研究生、以及软件工程专业(电子信息)专业硕士研究生。

科研项目:
曾经与正在承担相关项目500万。
学术论文:

* 共同第一作者, # 通信作者,标为红色的是近期论文。以下为部分论文列表,近期论文也可以在搜索引擎中用英文 Fengfeng Zhou 来检索。


1. Hao Zhang, Renchu Guan, Fengfeng Zhou, Yanchun Liang, Zhi-hui Zhan, Lan Huang, Xiaoyue Feng. “Deep Residual Convolutional Neural Network for Protein-Protein Interaction Extraction”. IEEE Access 7: 89354-89365, 2019.

2. Chenwei Lou, Jian Zhao, Ruoyao Shi, Qian Wang, Wenyang Zhou, Yubo Wang, Guoqing Wang#, Lan Huang, Xin Feng, Fengfeng Zhou#. “sefOri: selecting the best-engineered squence features to predict DNA replication origins”. Accepted by Bioinformatics, 2019.

3. Xin Feng, Xubing Hao, Ruihao Xin, Xiaoqian Gao, Minge Liu, Fei Li, Yubo Wang, Ruoyao Shi, Shishun Zhao#, Fengfeng Zhou#. “Detecting Methylomic Biomarkers of Pediatric Autism in the Peripheral Blood Leukocytes”. Accepted by Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 2019.

4. Yan Wang, Sen Yang, Jing Zhao, Wei Du, Yanchun Liang, Cankun Wang, Fengfeng Zhou, Yuan Tian, Qin Ma. “Using Machine Learning to Measure Relatedness Between Genes: A Multi-Features Model”. Scientific Reports, 9(1):4192, 2019.

5. Mingyang Jiang, Yanchun Liang, Zhili Pei, Xiye Wang, Fengfeng Zhou, Chengxi Wei, Xiaoyue Feng. “Diagnosis of Breast Hyperplasia and Evaluation of RuXian-I Based on Metabolomics Deep Belief Networks”. International Journal of Molecular Sciences, 20(11): 2620, 2019.

6. Xin Feng, Jialiang Li, Han Li, Hang Chen, Fei Li, Quewang Liu, Zhu-Hong You, Fengfeng Zhou#. “Age is important for the early-stage detection of breast cancer on both transcriptomic and methylomic biomarkers”. Frontiers in Genetics, 10: 212, 2019.

7. Kangning Li, Shangshang Wang, Chang Du, Yuxin Huang, Xin Feng, Fengfeng Zhou#. “Accurate Fatigue Detection Based on Multiple Facial Morphological Features”. Accepted by Journal of Sensors, 2019.

8. Ruochi Zhang, Ruixue Zhao, Xinyang Zhao, Di Wu, Weiwei Zheng, Xin Feng, Fengfeng Zhou#. “pyHIVE, a health-related image visualization and engineering system using Python”. BMC Bioinformatics, 19(1): 452, 2018.

9. Xin Feng, Ruochi Zhang, Minge Liu, Quewang Liu, Fei Li, Zhenwei Yan, Fengfeng Zhou#. “An accurate regression of developmental stages for breast cancer based on transcriptomic biomarkers”. Biomarkers in Medicine, 13(1): 5-15, 2018.

10. Xin Feng, Shaofei Wang, Quewang Liu, Han Li, Jiamei Liu, Cheng Xu, Weifeng Yang, Yayun Shu, Weiwei Zheng, Bingxin Yu, Mingran Qi, Wenyang Zhou, Fengfeng Zhou#. “Selecting Multiple Biomarker Subsets with Similarly Effective Binary Classification Performances”. Journal of Visualized Experiments (JoVE), 140: e57738, 2018.

11. Lei Wang, Zhu-Hong You, De-shuang Huang, Fengfeng Zhou. “Combining High Speed ELM Learning with a Deep Convolutional Neural Network Feature Encoding for Predicting Protein-RNA Interactions”. Accepted by IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2018.

12. Renchu Guan, Xu Wang, Mary Qu Yang, Yu Zhang, Fengfeng Zhou, Chen Yang, Yanchun Liang. “Multi-label Deep Learning for Gene Function Annotation in Cancer Pathways”. Scientific Reports, 8(1): 267, 2018.

13. Ruixue Zhao, Ruochi Zhang, Tongyu Tang, Xin Feng, Jialiang Li, Yue Liu, Renxiang Zhu, Guangze Wang, Kangning Li, Wenyang Zhou, Yunfei Yang, Yuzhao Wang, Yuanjie Ba, Jiaojiao Zhang, Yang Liu, Fengfeng Zhou#. “TriZ-a rotation-tolerant image feature and its application in endoscope-based disease diagnosis”. Computers in Biology and Medicine, 99: 182-190, 2018.

14. Yinda Zhang*, Shuhan Yang*, Yang Liu, Yexian Zhang, Bingfeng Han and Fengfeng Zhou#. “Integration of 24 Feature Types to Accurately Detect and Predict Seizures Using Scalp EEG Signals”. Sensors, 18(5): 1372, 2018.

15. Yanjiao Ren, Xin Feng, Xin Xia, Yexian Zhang, Wenniu Zhang, Jing Su, Zhongyu Wang, Ying Xu, and Fengfeng Zhou#. “Gender specificity improves the early-stage detection of clear cell renal cell carcinoma based on methylomic biomarkers”. Biomarkers in Medicine, 12(6): 607-618, 2018.

16. Yanjiao Ren, Shishun Zhao, Dandan Jiang, Xin Feng, Yexian Zhang, Zhipeng Wei, Zhongyu Wang, Wenniu Zhang, Qing F. Zhou 3, Yong Li, Hanxu Hou, Ying Xu#, Fengfeng Zhou#. “Proteomic biomarkers for lung cancer progression”. Biomarkers in Medicine, 12(3): 205-215, 2018.

Cheng Xu, Jiamei Liu, Weifeng Yang, Yayun Shu, Zhipeng Wei, Weiwei Zheng, Xin Feng, and Fengfeng Zhou#. “An OMIC biomarker detection algorithm TriVote and its application in methylomic biomarker detection”. Epigenomics, 10(4): 335-347, 2018


获奖情况: 1. 2016: Rank 4th, “Systems Toxicology Computational Challenge”, sbv IMPROVER competition 2016, Advisor of the team HILab.
2. 2015年:“中国好创意”全国青年大数据创新大赛(国家互联网信息办公室网络数据与技术局、中国计算机学会),“基于大数据的未知病原检测方法构建”赛题,二等奖,HI-15MW代表队,指导老师。
3. 2014年:第二届中国大数据技术创新大赛(中国计算机学会大数据专家委员会),HILab_SIAT代表队,成功参与奖,指导老师。
4. 2013年:疾病预警建模算法NetTrans荣获2013年度国际IMPROVER疾病预警建模竞赛第四名(共28个国际团队参加)。颁奖及学术交流会议,希腊雅典,2013年10月29-31日。
5. 2013年:深圳市“孔雀计划”B类人才。
6. 2012年:疾病预警建模算法cPsoriasis荣获2012年度国际IMPROVER疾病预警建模竞赛-自免疫疾病第三名(共55个国际团队参加)。颁奖及学术交流会议,美国波士顿,2012年10月2-3日。
社会兼职:
1. 委员(2016-现在,首批委员),中国计算机学会生物信息学专业组,2016年-现在。
2. 委员(2016-现在),中国计算机学会计算机应用专业委员会,2016年-现在。
3. 通讯委员(2016-现在),中国计算机学会大数据专业委员会,2016年-现在。
4. 高级会员(2016年-现在),会员(2013-2016),中国计算机学会,2016-现在。
5. 终身会员(2013-现在),中国运筹学会,2013-现在。
6. 高级会员(2013-现在),会员(2012-2013),IEEE。
治学格言: 鼓励探索、严谨治学


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